Kerajaan Hitu di Ambon menjadi sasaran selanjutnya. Namun Kompeni tidak dapat dengan mudah menaklukkan Kerajaan Hitu. Sebab, Kerajaan Hitu pernah mengusir penjajah Portugis sebelumnya. Gelora perlawanan Kerajaan Hitu dikomandoi oleh Kapitan Telukabessy. Tidak ada dua potensi di Telukabessy melawan Belanda. Ia tak khawatir Belanda jauh dari jumlah pasukannya. Karena yang dipahami Telukabessy adalah pertarungan.
Perlawanan Telukabessy kemudian mereda ketika Kompeni mengepung kantor pusatnya di Gunung Kapahaha dan menawan orang-orang di dalamnya. Bisa jadi Telukabessy berhasil lolos dari kepungan tersebut.
Namun ancaman Kompeni yang ingin membunuh para pengikutnya membuat semuanya menjadi nyata. Telukabessy akhirnya menyerah. Setelah itu, ia dijatuhi hukuman mati di halaman Benteng Victoria karena dianggap merugikan Kompeni pada tanggal 3 September 1646.
Akhirnya pada tanggal 27 Juli 1646, benteng utama di puncak gunung Kapahaha yang menjadi markas Telukabessy diserbu oleh pasukan VOC. Pertarungan terjadi cukup sengit. Anak buah Telukabessy berjuang mati-matian mempertahankan benteng terakhir ini. Namun Telukabessy harus mengakui keunggulan senjata VOC.
Banyak anak buahnya yang tewas dalam pertempuran ini. Telukabessy sendiri lolos dari penggerebekan tersebut. Ia sudah lama berkelana di sekitar Hitu menunggu saat yang tepat untuk menyerang VOC kembali.
